Динамика выявления РНК вируса SARS-CoV-2 у пациентов и сотрудников ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России в первые 2 года пандемии новой коронавирусной инфекции COVID-19

О.Г. Старкова, Д.С. Тихомиров, А.Ю. Крылова, И.О. Снежко, Е.Н. Овчинникова, О.А. Алешина, Т.А. Туполева, Т.В. Гапонова

ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России, Новый Зыковский пр-д, д. 4, Москва, Российская Федерация, 125167

Для переписки: Оксана Газимагомедовна Старкова, Новый Зыковский пр-д, д. 4, Москва, Российская Федерация, 125167; тел.: +7(966)189-57-12; e-mail: oksanastar2006@rambler.ru

Для цитирования: Старкова О.Г., Тихомиров Д.С., Крылова А.Ю. и др. Динамика выявления РНК вируса SARS-CoV-2 у пациентов и сотрудников ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России в первые 2 года пандемии новой коронавирусной инфекции COVID-19. Клиническая онкогематология. 2023;16(2):186–91.

DOI: 10.21320/2500-2139-2023-16-2-186-191


РЕФЕРАТ

Актуальность. COVID-19 потребовал кардинальных изменений в организации здравоохранения, в частности оказания медицинской помощи онкологическим и гематологическим больным. Минимизировано число визитов в медицинские организации, 75 % приемов врачей переведены в формат телемедицинских консультаций. Среди решений, направленных на предотвращение распространения COVID-19, были создание обсервационных отделений, разграничение потоков пациентов и сотрудников, регулярное тестирование на наличие РНК SARS-CoV-2, сокращение сроков госпитализаций и перевод пациентов с положительным тестом на COVID-19 в перепрофилированные под новую коронавирусную инфекцию стационары, предоставление только экстренной медицинской помощи и, по возможности, перевод системной противоопухолевой терапии в формат лечения препаратами для приема внутрь и др.

Цель. Оценить динамику выявления РНК SARS-CoV-2 в ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России с апреля 2020 г. по январь 2022 г. на фоне предпринятых противоэпидемических мер.

Материалы и методы. Основу исследования составляют результаты тестирования на РНК SARS-CoV-2 биоматериала мазков из носо- и ротоглотки от пациентов и сотрудников ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России (далее — Центра). Кроме того, на РНК SARS-CoV-2 исследовались бронхоальвеолярная лаважная жидкость, биоптат легочной ткани, мокрота. Исследование проводилось с использованием наборов реагентов «ПЦР-РВ-2019-nCov» ООО «Синтол» на базе отдела вирусологии Центра.

Результаты. Выполнено 107 470 исследований: 58 141 (54 %) — сотрудники, 45 126 (46 %) — пациенты; 35 508 (33 %) — мужчины, 71 962 (67 %) — женщины. В 1318 случаях РНК SARS-CoV-2 была обнаружена, что составило 1,15 % от общего числа исследований. При этом в группах сотрудников/пациентов частота выявления возбудителя составила 1,42 и 1,09 % (< 0,001), а в группах мужчин/женщин — 1,3 и 1,2 % соответственно (= 0,154). Частота инфицированности в группах пациентов с опухолевыми и неопухолевыми заболеваниями системы крови по результатам тестирования на РНК SARS-CoV-2 составила 1,24 и 0,92 % соответственно (= 0,147). Отмечался волнообразный профиль частоты выявления возбудителя у сотрудников и пациентов Центра. Наибольшее число инфицированных было зафиксировано в апреле — июне 2020 г. (79 пациентов и 170 сотрудников), октябре — декабре 2020 г. (126 пациентов и 190 сотрудников) и в январе 2022 г. (59 пациентов и 203 сотрудника), что соответствовало первой, второй и пятой волнам распространения COVID-19 в России.

Заключение. При анализе данных, полученных на базе ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России, показано, что волнообразный профиль выявления РНК SARS-CoV-2 у сотрудников и пациентов Центра соответствовал общей тенденции по России. Частота определения РНК SARS-CoV-2 не зависела от пола обследованных лиц и не имела статистически значимых различий у пациентов с опухолевыми и неопухолевыми заболеваниями системы крови. Несмотря на то что пациенты гематологического стационара более подвержены развитию тяжелых инфекционных осложнений, лабораторные маркеры возбудителя COVID-19 обнаруживались у них реже, чем у сотрудников Центра.

Ключевые слова: COVID-19, РНК SARS-CoV-2, новая коронавирусная инфекция, гематологические больные, опухолевые и неопухолевые заболевания системы крови.

Получено: 5 сентября 2022 г.

Принято в печать: 7 марта 2023 г.

Читать статью в PDF

Статистика Plumx русский

ЛИТЕРАТУРА

  1. Yang P, Wang X. COVID-19: a new challenge for human beings. Cell Mol Immunol. 2020;17(5):555–7. doi: 10.1038/s41423-020-0407-x.
  2. Bhagat S, Yadav N, Shah J, et al. Novel corona virus (COVID-19) pandemic: current status and possible strategies for detection and treatment of the disease. Expert Rev Anti Infect Ther. 2022;20(10):1275–98. doi: 10.1080/14787210.2021.1835469.
  3. Львов Д.К. Альховский С.В. Истоки пандемии COVID-19: экология и генетика коронавирусов (Betacoronavirus: Coronaviridae) SARS-COV, SARS-COV-2 (подрод Sarbecovirus), MERS-COV (подрод Merbecovirus). Вопросы вирусологии. 2020;65(2):62–70. doi: 10.36233/0507-4088-2020-65-2-62-70.
    [Lvov DK, Alkhovsky SV. Source of the COVID-19 pandemic: ecology and genetics of coronaviruses (Betacoronavirus: Coronaviridae) SARS-CoV, SARS-CoV-2 (subgenus Sarbecovirus), and MERS-CoV (subgenus Merbecovirus). Problems of Virology. 2020;65(2):62–70. doi: 10.36233/0507-4088-2020-65-2-62-70. (In Russ)]
  4. Drosten C, Gunther S, Preiser W, et al. Identification of a novel coronavirus in patients with severe acute respiratory syndrome. N Engl J Med. 2003;348(20):1967–76. doi: 10.1056/NEJMoa030747/
  5. Львов Д.К., Альховский С.В., Колобухина Л.В., Бурцева Е.И. Этиология эпидемической вспышки COVID-19 в г. Ухань (провинция Хубэй, Китайская Народная Республика), ассоциированной с вирусом 2019-nCoV (Nidovirales, Coronaviridae, Coronavirinae, Betacoronavirus, подрод Sarbecovirus): уроки эпидемии SARS-CoV. Вопросы вирусологии. 2020;65(1):6–16. doi: 10.36233/0507-4088-2020-65-1-6-15.
    [Lvov DK, Alkhovsky SV, Kolobukhina LV, Burtseva EI. Etiology of epidemic outbreaks COVID-19 in Wuhan, Hubei province, Chinese People Republic associated with 2019-nCoV (Nidovirales, Coronaviridae, Coronavirinae, Betacoronavirus, Subgenus Sarbecovirus): lessons of SARS-CoV outbreak. Problems of Virology. 2020;65(1):6–16. doi: 10.36233/0507-4088-2020-65-1-6-15. (In Russ)]
  6. Гарафутдинов Р.Р., Мавзютов А.Р., Никоноров Ю.М. и др. Бетакоронавирус SARS-CoV-2, его геном, разнообразие генотипов и молекулярно-биологические меры борьбы с ним. Биомика. 2020;12(2):242–71. doi: 10.31301/2221-6197.bmcs.2020-15.
    [Garafutdinov RR, Mavzyutov AR, Nikonorov YuM, et al. Betacoronavirus SARS-CoV-2, its genome, variety of genotypes and molecular-biological approaches to combat it. Biomics. 2020;12(2):242–71. doi: 10.31301/2221-6197.bmcs.2020-15. (In Russ)]
  7. Isidori A, de Level L, Gergis U, et al. Management of patients with hematologic malignancies during the COVID-19 pandemic: Practical considerations and lessons to be learned. Front Oncol. 2020;10:1439. doi: 10.3389/fonc.2020.01439.
  8. Salako O, Okunade K, Allsop M, et al. Upheaval in cancer care during the COVID-19 outbreak. Ecancermedicalscience. 2020;14:ed97. doi: 10.3332/ecancer.2020.ed9.
  9. Gupta M, Ahuja R, Gupta S, et al. Running of high patient volume radiation oncology department during COVID-19 crisis in India: Our institutional strategy. Radiat Oncol J. 2020;38(2):93–8. doi: 10.3857/roj.2020.0019
  10. Dalu D, Rota S, Cona MS, et al. A proposal of a “ready to use” COVID-19 control strategy in an Oncology ward: Utopia or reality? Crit Rev Oncol Hematol. 2021;157:103168. doi: 10.1016/j.critrevonc.2020.103168.
  11. Leung MST, Lin SG, Chow J, Harky A. COVID-19 and Oncology: Service transformation during pandemic. Cancer Med. 2020;9(19):7161–71. doi: 10.1002/cam4.3384.
  12. He Y, Lin Z, Tang D, et al. Strategic plan for management of COVID-19 in paediatric haematology and oncology departments. Lancet Haematol. 2020;7(5):e359–е doi: 10.1016/S2352-3026(20)30104-6.
  13. Гаврилина О.А., Васильева А.Н., Галстян Г.М. и др. Опыт работы обсервационного отделения для больных с патологией системы крови во время пандемии COVID-19. Гематология и трансфузиология. 2021;66(1):8–19. doi: 10.35754/0234-5730-2021-66-1-8-19.
    [Gavrilina OA, Vasileva AN, Galstyan GM, et al. Experience of haematological observatory ward during COVID-10 pandemic. Russian journal of hematology and transfusiology. 2021;66(1):8–19. doi: 10.35754/0234-5730-2021-66-1-8-19. (In Russ)]
  14. Годков М.А., Шустов В.В., Кашолкина Е.А. Динамика и гендерно-возрастные особенности эпидемического процесса COVID-19 в городе Москве (итоги скринингового обследования за 1,5 года). Лабораторная служба. 2021;10(4):30–7. doi: 10.17116/labs20211004130.
    [Godkov MA, Shustov VV, Kasholkina EA. Dynamics and gender and age features of the COVID-19 EPIDEMIC process in Moscow (results of screening survey for 1.5 years). Laboratornaya sluzhba. 2021;10(4):30–7. doi: 10.17116/labs20211004130. (In Russ)]
  15. Официальная статистика COVID-19 в России. [Интернет] Доступно по: https://coronavirusstat.ru/?ysclid=lc6d Ссылка активна на 27.12.2022. [Official COVID-19 morbidity statistics in Russia. (Internet) Available from: https://coronavirusstat.ru/?ysclid=lc6dwvg036948485677. Accessed 27.12.2022. (In Russ)]
  16. Liang W, Guan W, Chen R, et al. Cancer patients in SARS-CoV-2 infection: A nationwide analysis in China. Lancet Oncol. 2020;21(3):335–7. doi: 10.1016/S1470-2045(20)30096-6.

COVID-19 у пациентов с онкогематологическими заболеваниями

А.А. Даниленко, С.В. Шахтарина, Н.А. Фалалеева

Медицинский радиологический научный центр им. А.Ф. Цыба — филиал ФГБУ «НМИЦ радиологии» Минздрава России, ул. Королева, д. 4, Обнинск, Калужская область, Российская Федерация, 249036

Для переписки: Анатолий Александрович Даниленко, д-р мед. наук, ул. Королева, д. 4, Обнинск, Калужская область, Российская Федерация, 249036; тел.: +7(909)250-18-10; e-mail: danilenkoanatol@mail.ru

Для цитирования: Даниленко А.А., Шахтарина С.В., Фалалеева Н.А. COVID-19 у пациентов с онкогематологическими заболеваниями. Клиническая онкогематология. 2021;14(2):220–4.

DOI: 10.21320/2500-2139-2021-14-2-220-224


РЕФЕРАТ

Эпидемия COVID-19, разразившаяся в Ухане (Китай), быстро переросла в пандемию. Высокая смертность от этого заболевания ставит его в ряд наиболее опасных вирусных инфекционных болезней настоящего времени. В то время как наибольшему риску летального исхода подвержены лица пожилого возраста, некоторые сопутствующие заболевания, среди которых вполне могут быть и злокачественные опухоли, также существенно ухудшают течение COVID-19. В силу присущего иммунодефицита, усугубляемого иммуносупрессивной противоопухолевой терапией, ведущее место по влиянию на течение COVID-19 занимают онкогематологические заболевания. В обзоре представлены немногочисленные опубликованные сведения о влиянии коронавирусной инфекции на прогноз у пациентов с опухолями кроветворной и лимфоидной тканей. Кроме того, обсуждаются возможные меры по снижению у этих больных риска летального исхода.

Ключевые слова: SARS-CoV-2, COVID-19, онкогематологические заболевания, смертность.

Получено: 13 октября 2020 г.

Принято в печать: 15 февраля 2021 г.

Читать статью в PDF

Статистика Plumx русский

ЛИТЕРАТУРА

  1. Johns Hopkins University of Medicine. COVID-19 Dashboard by the Center for Systems Science and Engineering (CSSE) at Johns Hopkins University (JHU). Available from: https://coronavirus.jhu.edu/map.html. Accessed 02.2021.
  2. Rassy E, Khoury-Abboud R-M, Ibrahim N, et al. What the oncologist needs to know about COVID-19 infection in cancer patients. Fut Oncol. 2020;16(17):1153–6. doi: 10.2217/fon-2020-0312.
  3. Mina A, van Besien K, Platanias LC, et al. Hematological manifestations of COVID-19. Leuk Lymphoma. 2020;61(12):2790–8. doi: 10.1080/10428194.2020.1788017.
  4. Bhatraju PK, Ghassemieh BJ, Nichols M, et al. Covid-19 in critically ill patients in the Seattle Region – case series. N Engl J Med. 2020;382(21):2012–22. doi: 10.1056/nejmoa2004500.
  5. Wang F, Nie J, Wang H, et al. Characteristics of peripheral lymphocyte subset alteration in COVID-19 pneumonia. J Infect Dis. 2020;221(11):1762–69. doi: 10.1093/infdis/jiaa150.
  6. Guan W-J, Ni Z-Y, Hu Y, et al. Clinical characteristics of coronavirus disease 2019 in China. N Engl J Med. 2020;382(18):1708–20. doi: 10.1056/NEJMoa2002032.
  7. Maquet J, Lafaurie M, Sommet A, et al. Thrombocytopenia is independently associated with poor outcome in patients hospitalized for COVID-19. Br J Haematol. 2020;190(5):e276–е279. doi: 10.1111/bjh.16950.
  8. Lippi G, Plebani M, Henry BM. Thrombocytopenia is associated with severe coronavirus disease 2019 (COVID-19) infections: a meta-analysis. Clin Chim Acta. 2020;506:145–8. doi: 10.1016/j.cca.2020.03.022.
  9. Cui S, Chen S, Li X, et al. Prevalence of venous thromboembolism in patients with severe novel coronavirus pneumonia. J Thromb Haemost. 2020;18(6):1421–4. doi: 10.1111/jth.14830.
  10. Klok FA, Kruip MJ, van der Meer NJ, et al. Incidence of thrombotic complications in critically ill ICU patients with COVID-19. Thromb Res. 2020;191:145–7. doi: 10.1016/j.thromres.2020.04.013.
  11. Friman V, Winqvist O, Blimark C, et al. Secondary immunodeficiency in lymphoproliferative malignancies. Hematol Oncol. 2016;34(3):121–32. doi: 10.1002/hon.2323.
  12. Yri OE, Torfoss D, Hungnes O, et al. Rituximab blocks protective serologic response to influenza a (H1N1) 2009 vaccination in lymphoma patients during or within 6 months after treatment. Blood. 2011;118(26):6769–71. doi: 10/1182/blood-2011-08-372649.
  13. Tepasse P-R, Hafezi W, Lutz M, et al. Persisting SARS-CoV-2 viraemia after rituximab therapy: two cases with fatal outcome and a review of the literature. Br J Haematol. 2020;190(2):185–8. doi: 10.1111/bjh.16896.
  14. Davids MS, Hallek M, Wierda W, et al. Comprehensive safety analysis of Venetoclax monotherapy for patients with relapsed/refractory chronic lymphocytic leukemia. Clin Cancer Res. 2018;24(18):4371–9. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-17-3761.
  15. Van de Haar J, Hoes LR, Coles CE, et al. Caring for patients with cancer in the COVID-19 era. Nat Med. 2020;26(5):665–71. doi: 10.1038/s41591-020-0874-8.
  16. Lee LYW, Cazier J-B, Starkey T, et al. COVID-19 prevalence and mortality in patients with cancer and the effect of primary tumour subtype and patient demographics: a prospective cohort study. Lancet Oncol. 2020;21(10):1309–16. doi: 10.1016/S1470-2045(20)30442-3.
  17. Yang K, Sheng Y, Huang C, et al. Clinical characteristics, outcomes, and risk factors for mortality in patients with cancer and COVID-19 in Hubei, China: a multicentre, retrospective, cohort study. Lancet Oncol. 2020;21(7):904–13. doi: 10.1016/S1470-2045(20)30310-7.
  18. Booth S, Willan J, Wong H, et al. Regional outcomes of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 infection in hospitalised patients with haematological malignancy. Eur J Haematol. 2020;105(4):476–83. doi: 10.1111/ejh.13469.
  19. Wu Y, Chen W, Li W, et al. Clinical characteristics, therapeutic management, and prognostic factors of adult COVID-19 inpatients with hematological malignancies. Leuk Lymphoma. 2020;61(14):3440–50. doi: 10.1080/10428194.2020.1808204.
  20. Sanchez-Pina JM, Rodriguez RM, Castro Quismondo N, et al. Clinical course and risk factors for mortality from COVID-19 in patients with haematological malignancies. Eur J Haematol. 2020;105(5):597–607. doi: 10.1111/ejh.13493.
  21. Yigenoglu TN, Ata N, Altuntas F, et al. The Outcome of COVID-19 in Patients with Hematological Malignancy. J Med Virol. 2021;93(2):1099–104. doi: 10.1002/jmv.26404.
  22. He W, Chen L, Chen L, et al. COVID-19 in persons with haematological cancers. Leukemia. 2020;34(6):1637–45. doi: 10.1038/s41375-020-0836-7.
  23. Aries JA, Davies JK, Auer LR, et al. Clinical outcome of coronavirus disease 2019 in haemato-oncology patients. Br J Haematol. 2020;190(2):64–7. doi: 10.1111/bjh.16852.
  24. Passamonti F, Cattaneo C, Arcaini L, et al. Clinical characteristics and risk factors associated with COVID-19 severity in patients with haematological malignancies in Italy: a retrospective, multicentre, cohort study. Lancet Haematol. 2020;7(10):e737–e745. doi: 10.1016/S2352-3026(20)30251-9.
  25. Mato AR, Roeker LE, Lamanna N, et al. Outcomes of COVID-19 in patients with CLL: a multicenter international experience. Blood. 2020;136(10):1134–43. doi: 10.1182/blood.2020006965.
  26. Haroon A, Alassani M, Aljurf M, et al. COVID-19 post Hematopoietic Cell Transplant, a Report of 11 Cases from a Single Center. Mediterr J Hematol Infect Dis. 2020;12(1):e2020070. doi: 10.4084/MJHID.2020.070.
  27. Shah GL, De Wolf S, Lee YJ, et al. Favorable outcomes of COVID-19 in recipients of hematopoietic cell transplantation. J Clin Invest. 2020;130(12):6656–67. doi: 10.1172/jci141777.
  28. Perini GF, Fischer T, Gaiolla RD, et al. How to manage lymphoid malignancies during novel 2019 coronavirus (CoVid-19) outbreak: a Brazilian task force recommendation. Hematol Transfus Cell Ther. 2020;42(2):103–10. doi: 10.1016/j.htct.2020.04.002.
  29. Di Ciaccio P, McCaughan G, Trotman J, et al. Australian and New Zealand consensus statement on the management of lymphoma, chronic lymphocytic leukaemia and myeloma during the COVID-19 pandemic. Intern Med J. 2020;50(6):667–79. doi: 10.1111/imj.14859.
  30. De la Cruz-Benito B, Lazaro-Del Campo P, Ramirez-Lopez A, et al. Managing the front-line treatment for diffuse large B-cell lymphoma and high-grade B-cell lymphoma during the COVID-19 outbreak. Br J Haematol. 2020;191(3):386–9. doi: 10.1111/bjh.17066.
  31. Yahalom J, Dabaja BS, Ricardi U, et al. ILROG emergency guidelines for radiation therapy of hematological malignancies during the COVID-19 pandemic. Blood. 2020;135(21):1829–32. doi: 10.1182/blood.2020006028.
  32. Vordermark D. Shift in indications for radiotherapy during the COVID-19 pandemic? A review of organ-specific cancer management recommendations from multidisciplinary and surgical expert groups. Radiat Oncol. 2020;15(1):140. doi: 10.1186/s13014-020-01579-3.