профиль экспрессии генов

Использование достижений современных геномных технологий при лимфомах

ОБЗОРЫ , , , ,

М.В. Немцова1, М.В. Майорова2

1 Российская медицинская академия последипломного образования Минздрава России, ул. Баррикадная, д. 2/1, Москва, Российская Федерация, 125993

2 Московский научно-исследовательский онкологический институт им. П.А. Герцена, 2-й Боткинский пр-д, д. 3, Москва, Российская Федерация, 125284

Для переписки: Марина Вячеславовна Немцова, д-р биол. наук, профессор, ул. Баррикадная, д. 2/1, Москва, Российская Федерация, 125993; тел.: +7(499)252-21-04; e-mail: nemtsova_m_v@mail.ru

Для цитирования: Немцова М.В., Майорова М.В. Использование достижений современных геномных технологий при лимфомах. Клиническая онкогематология. 2016;9(3):265-70.

DOI: 10.21320/2500-2139-2016-9-3-265-270

РЕФЕРАТ

Современные достижения в области геномики и биологии рака позволили значительно расширить объем знаний о молекулярном патогенезе лимфом. С использованием полногеномных методов исследования и современных компьютерных технологий удалось доказать, что разнообразные гистологические и иммуноморфологические подтипы лимфом различаются на молекулярном уровне и возникают в результате действия различных онкогенных механизмов. Стало понятно, что в основе вариабельности клинических симптомов, которые наблюдаются у пациентов с лимфомами, лежат как гетерогенность опухолевых клеток, так и особенности молекулярного патогенеза. Основываясь на полученных данных, предложены стратегии для разработки новых препаратов, которые сегодня используются в лечении лимфом. Они включают определение молекулярных этапов патогенеза, оценку значимости каждого этапа для развития опухоли и получение препарата с направленным действием на этот этап. В результате предложено несколько новых классов молекулярных таргетных агентов для лечения лимфом, которые сегодня изучаются в клинических исследованиях. В современную эпоху персонализированной медицины одной из основных задач при лечении пациентов с лимфомами является определение правильной таргетной терапии для каждого типа лимфоидной опухоли, характеризующейся уникальными молекулярными механизмами опухолеобразования.

Ключевые слова: лимфомы, профиль экспрессии генов, микроРНК, сигнальные пути, NF-kB.

Получено: 13 февраля 2016 г.

Принято в печать: 14 марта 2016 г.

Читать статью в PDFpdficon

ЛИТЕРАТУРА

  1. Intlekofer AM, Younes A. Precision therapy for lymphoma—current state and future directions. Nat Rev Clin Oncol. 2014;11(10):585–96. doi: 10.1038/nrclinonc.2014.137.
  2. Roschewski M, Staudt LM, Wilson WH. Diffuse large B-cell lymphoma—treatment approaches in the molecular era. Nat Rev Clin Oncol. 2014;11(1):12–23. doi: 10.1038/nrclinonc.2013.197.
  3. Borchmann P, Eichenauer DA, Engert A. State of the art in the treatment of Hodgkin lymphoma. Nat Rev Clin Oncol. 2012;9(8):450–9. doi: 10.1038/nrclinonc.2012.91.
  4. Campo E, Swerdlow SH, Harris NL, et al. The 2008 WHO classification of lymphoid neoplasms and beyond: evolving concepts and practical applications. Blood. 2011;117(19):5019–32. doi: 10.1182/blood-2011-01-293050.
  5. Немцова М.В., Кушлинский Н.Е. Достижения высокотехнологичных геномных методов для практической онкологии. Медицинский алфавит. 2015;1(2):10–3.
    [Nemtsova MV, Kushlinskii NE. The achievement of high-genomic methods for practical oncology. Meditsinskii alfavit. 2015;1(2):10–3. (In Russ)]
  6. Alizadeh AA, Eisen MB, Davis RE, et al. Distinct types of diffuse large B-cell lymphoma identified by gene expression profiling. Nature. 2000;403(6769):503–11. doi: 10.1038/35000501.
  7. Lenz G, Dave SS, Xiao W, et al. Stromal gene signatures in large-B-cell lymphomas. N Engl J Med. 2008;359(22):2313–23. doi: 10.1056/NEJMoa0802885.
  8. Ngo VN, Davis RE, Lamy L, et al. A loss-of-function RNA interference screen for molecular targets in cancer. Nature. 2006;441(7089):106–10. doi: 10.1038/nature04687.
  9. Compagno M, Lim WK, Grunn A, et al. Mutations of multiple genes cause deregulation of NF-kappa B in diffuse large B-cell lymphoma. Nature. 2009;459(7247):717–21. doi: 10.1038/nature07968.
  10. Lenz G, Davis RE, Ngo VN, et al. Oncogenic CARD11 mutations in human diffuse large B cell lymphoma. Science. 2008;319(5870):1676–9. doi: 10.1126/science.1153629.
  11. Wilson WH. The Bruton’s tyrosine kinase (BTK) inhibitor, ibrutinib (PCI-32765), has preferential activity in the ABC subtype of relapsed/refractory de novo diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL): interim results of a multicentre, open-label, phase 2 study. Blood. 2012;120: Abstract 686.
  12. Wang ML, Rule S, Martin P, et al. Targeting BTK with ibrutinib in relapsed or refractory mantle-cell lymphoma. N Engl J Med. 2013;369(6):507–16. doi: 10.1056/NEJMoa1306220.
  13. Morin RD, Mendez-Lago M, Mungall AJ, et al. Frequent mutation of histone-modifying genes in non-Hodgkin lymphoma. Nature. 2011;476(7360):298–303. doi: 10.1038/nature10351.
  14. Chi P, Allis CD, Wang GG. Covalent histone modifications—miswritten, misinterpreted and mis-erased in human cancers. Nat Rev Cancer. 2010;10(7):457–69. doi: 10.1038/nrc2876.
  15. Pasqualucci L, Dominguez-Sola D, Chiarenza A, et al. Inactivating mutations of acetyltransferase genes in B-cell lymphoma. Nature. 2011;471(7337):189–95. doi: 10.1038/nature09730.
  16. Lane AA, Chabner BA. Histone deacetylase inhibitors in cancer therapy. J Clin Oncol. 2009;27(32):5459–68. doi: 10.1200/jco.2009.22.1291.
  17. Yap DB, Chu J, Berg T, et al. Somatic mutations at EZH2 Y641 act dominantly through a mechanism of selectively altered PRC2 catalytic activity, to increase H3K27 trimethylation. Blood. 2011;117(8):2451–9. doi: 10.1182/blood-2010-11-321208.
  18. Beguelin W, Popovic R, Teater M, et al. EZH2 is required for germinal centre formation and somatic EZH2 mutations promote lymphoid transformation. Cancer Cell. 2013;23(5):677–92. doi: 10.1016/j.ccr.2013.04.011.
  19. Cairns RA, Iqbal J, Lemonnier F, et al. IDH2 mutations are frequent in angioimmunoblastic T-cell lymphoma. Blood. 2012;119(8):1901–3. doi: 10.1182/blood-2011-11-391748.
  20. Wang F, Travins J, DeLaBarre B, et al. Targeted inhibition of mutant IDH2 in leukemia cells induces cellular differentiation. Science. 2013;340(6132):622–6. doi: 10.1126/science.1234769.
  21. Pasqualucci L, Khiabanian H, Fangazio M, et al. Genetics of follicular lymphoma transformation. Cell Rep., 2014;6(1):130–40. doi: 10.1016/j.celrep.2013.12.027.
  22. Schmitz R, Young RM, Ceribelli M, et al. Burkitt lymphoma pathogenesis and therapeutic targets from structural and functional genomics. Nature. 2012;490(7418):116–20. doi: 10.1038/nature11378.
  23. Bea S, Valdes-Mas R, Navarro A, et al. Landscape of somatic mutations and clonal evolution in mantle cell lymphoma. Proc Natl Acad Sci USA. 2013;110(45):18250–5. doi: 10.1073/pnas.1314608110.
  24. Rossi D, Trifonov V, Fangazio M, et al. The coding genome of splenic marginal zone lymphoma: activation of NOTCH2 and other pathways regulating marginal zone development. J Exp Med. 2012;209(9):1537–51. doi: 10.1084/jem.20120904.
  25. Новикова М.В., Рыбко В.А., Хромова Н.В. и др. Роль белков Notch в процессах канцерогенеза. Успехи молекулярной онкологии. 2015;2(3):30–42. doi: 10.17650/2313-805X-2015-2-3-30-42.
    [Novikova MV, Rybko VA, Khromova NV, et al. The role of Notch pathway in carcinogenesis. Advances in molecular oncology. 2015;2(3):30–42. doi: 10.17650/2313-805X-2015-2-3-30-42. (In Russ)]
  26. Zhang J, Grubor V, Love CL, et al. Genetic heterogeneity of diffuse large B-cell lymphoma. Proc Natl Acad Sci USA. 2013;110(4):1398–403. doi: 10.1073/pnas.1205299110.
  27. Rahal R, Frick M, Romero R, et al. Pharmacological and genomic profiling identifies NF-kappaB-targeted treatment strategies for mantle cell lymphoma. Nat Med. 2014;20(1):87–92. doi: 10.1038/nm.3435.
  28. Anderson K, Lutz C, van Delft FW, et al. Genetic variegation of clonal architecture and propagating cells in leukaemia. Nature. 2011;469(7330):356–61. doi: 10.1038/nature09650.
  29. Ding L, Ley TJ, Larson DE, et al. Clonal evolution in relapsed acute myeloid leukaemia revealed by whole-genome sequencing. Nature. 2012;481(7382):506–10. doi: 10.1038/nature10738.
  30. Arcaini L, Rossi D. Nuclear Factor-kB Dysregulation In Splenic Marginal Zone Lymphoma: New Therapeutic Opportunities. Haematologica. 2012;97(5):638–40. doi: 10.3324/haematol.2011.058362.